DNA-Extraktion
Isolation genomischer DNA aus Saatgut und Blattmaterial über silica-beschichtete Magnetbeads mit einem von HelixSeed entwickelten Kit, im Hochdurchsatz.
Molekulare Saatgutdiagnostik · Graz
Genetische Identität. Mit Sicherheit.
HelixSeed bestimmt an der Charge, welcher Genotyp vorliegt: Sortenechtheit, Reinheit und diagnostische Marker. Ein Merkmal der Sorte wird erst zur Eigenschaft der Ware, wenn es in der Partie nachweisbar ist.
Unsere Vision
Der Klimawandel wartet nicht. Saatgut darf es auch nicht.
Dürre. Hitze. Ernteausfälle. Die Landwirtschaft steht unter Druck wie nie zuvor, und jede Antwort darauf beginnt im Saatgut. Trockentoleranz, Sortenreinheit und Ertragsstabilität sind genetisch angelegt, lange bevor ein Feld bestellt wird.
Genau dort fehlt der Beweis. Sorten werden auf Stresstoleranz gezüchtet, vermehrt, gehandelt und ausgesät, doch ob ihre Genetik tatsächlich in der jeweiligen Partie steckt, wird selten molekular belegt. Ein Etikett ist ein Versprechen. Wir machen daraus einen Nachweis.
Unser Fundament: jahrelange Erfahrung in der COVID-Diagnostik, null Spielraum für Fehler. Diese Präzision bringen wir ins Saatgut – mit modernen Verfahren:
- DNA-Extraktion über Magnetbeads
- Spektrophotometrische Reinheitsprüfung
- KASP- und HRM-Genotypisierung
- Nanopore-Sequenzierung Coming soon
Für Züchtung, Vermehrung und Handel, entlang der gesamten Wertschöpfungskette. Mit Sorgfalt in jeder Probe und Analysen, die auf Ihre Fragestellung zugeschnitten sind.
HelixSeed hebt Saatgutqualität auf die nächste Stufe. Von der Annahme zum Beweis.
Leistungen
Genotypisierung und Nukleinsäureanalytik an Saatgutpartien und Zuchtmaterial.
Spektrophotometrische Reinheit
Spektralphotometrische Bestimmung von Nukleinsäurekonzentration und Reinheitsverhältnissen (A260/280, A260/230) als Mikrovolumen-Messung, ergänzt durch Agarose-Gelelektrophorese zur Prüfung der DNA-Integrität.
Sortenreinheit
Wie viel Prozent der Partie sind Fremdtypen? Aus der Charge wird eine repräsentative Stichprobe von 400 Körnern entnommen; ein definierter Genomabschnitt wird per PCR vervielfältigt und per HRM geschmolzen. Aus der Abweichung von der Referenzschmelzkurve der Sorte wird semiquantitativ auf den Anteil an Fremdtypen geschlossen, besonders aussagekräftig bei Selbstbefruchtern wie Weizen, Gerste oder Soja.
Züchtungsprojekte
Genotypisierung von Zuchtlinien und Segregationspopulationen zur Identitäts- und Linienkontrolle, mit Dokumentation zwischen Zuchtgarten und Labor.
Merkmalsgenotypisierung mit KASP
Linien und Nachkommen werden mit KASP-Markern genotypisiert, die eng mit einem Merkmal gekoppelt sind, etwa Krankheitsresistenz oder Trocken- und Hitzetoleranz. So lässt sich schon am Keimling feststellen, ob eine Pflanze die gewünschte Genvariante trägt, bevor sich das Merkmal im Feld zeigt. Ein Marker ist dabei nur so aussagekräftig wie seine belegte Kopplung zum Merkmal.
Markeridentifizierung
Identifikation diagnostischer Polymorphismen (SNP und indel) zwischen Linien bzw. zwischen toleranten und anfälligen Genotypen, einschließlich Trocken- und Hitzemarkern.
Methylierungsanalyse Coming soon
Nachweis von 5-Methylcytosin in pflanzlicher gDNA in den Sequenzkontexten CG, CHG und CHH. Ergänzung zur Nukleotidsequenz, soweit Methylierung für Saatgutphysiologie oder abiotische Toleranz relevant ist.
Sequenzierung Coming soon
Nukleotidbestimmung über definierte Loci bzw. längere Fragmente. Einsatz, wenn Einzelmarker-Assays (HRM, KASP) für Identität oder Markerentwicklung nicht ausreichen.
Methoden
Jede Antwort erfordert die passende Frage.
gDNA-Extraktion
Silica-Magnetbeads
— Hochdurchsatz
Isolation genomischer DNA aus Saatgut- und Blattproben über silica-beschichtete Magnetbeads, mit einem von HelixSeed entwickelten Kit. Gleiche Bindungschemie über die Charge, skalierbar auf hohe Probenzahlen.
Ausgangsstufe für HRM, KASP und Sequenzierung. Ohne dokumentierte Extraktion ist das Genotypisierungsergebnis der Partie nicht interpretierbar.
NanoDrop
UV-Vis
— Spektrophotometrische Reinheit
Mikrovolumen-Messung von Nukleinsäurekonzentration und Reinheit über Absorption bei 260 nm sowie die Quotienten A260/280 und A260/230.
Kontrolle nach der Extraktion, vor Genotypisierung und Sequenzierung; ergänzend prüft die Gelelektrophorese die DNA-Integrität.
Hochauflösende Schmelzanalyse
HRM
— High Resolution Melting
Differenzierung von Amplicons über den Schmelzverlauf des Doppelstrangs. Sequenzunterschiede verschieben Tm und Kurvenform.
Semiquantitative Bestimmung der Sortenreinheit und Screening auf Heterogenität in der Charge, ohne allelspezifische Sonde.
Kompetitive allelspezifische PCR
KASP
— Kompetitive Allele Specific PCR
Alleldiskriminierung an definierten SNPs über kompetitive primer-basierte Fluoreszenz. Cluster: homozygot A, homozygot B, heterozygot.
Hochdurchsatz-Genotypisierung etablierter Marker, einschließlich Trocken- und Hitzetoleranz sowie Linienunterscheidung.
Sequenzierung mittels Nanopore Coming soon
ONT
— Oxford Nanopore
Long-read-Sequenzierung derselben gDNA nach Bead-Extraktion. Nukleotidbestimmung über mehrere Loci bzw. längere Fragmente.
Vorgesehen für Identitätskontrolle jenseits einzelner SNPs, Markerentwicklung und methylierungsrelevante Signale in derselben Chemie.
Labor
Unser Labor in Graz.
Standort
Zentrum für Wissens- und Technologietransfer in der Medizin (ZWT)
Neue Stiftingtalstraße 2
8010 Graz · Austria
Geschäftsführung
Nils Gigerl, BSc — Laborleitung
Bernhard Brauner-Runge, BSc — Sales Representative
info@helixseed.at
Anfrage
Inquiry — describe the lot, the crop and the question.